高血压、高血脂、糖尿病及心脏病等是目前已知脑血栓的危险因素，同时也是复发性脑血栓的危险因素。而且后者存在这些危险因素的程度更严重。因此，针对这些危险因素除了进行非药物性调整外，需积极针对危险因素进行防治性药物治疗。
汇总资料分析结果显示，合理调控血压治疗可使脑血栓复发的风险降低29％。理想血压应在120/80mmHg以下。当血压波动在120～139/80～89mmHg时，属于正常高值。当血压3天之内重复测量三次≧140/90mmHg时，高血压病有可能确诊了。由于近70％的脑血栓为高血压所致，所以高血压被认为是脑血栓最危险因素之一。从新近一期《美国医学杂志》资料获悉，对于高血压和心血管疾病高危患者，收缩压每降低1～3mmHg，脑血栓的相对危险性即可下降20～30％，从这个数据就可以看出治疗高血压的重要性。因为动脉血压的增高，实际上是形成对血管壁的损伤性挤压，日久必导致血管内皮损伤，随之血管内壁变成凹凸不平，使血管腔变窄，对血栓再次形成提供方便。同时被过高血压长期挤压的血管日久即会产生硬化，硬化了的血管显然也是导致血栓形成的一个条件。首发脑血栓后血压水平高于160／100mmHg，可加快加重动脉硬化发展的速度和程度，血压越高发生脑血栓或复发脑血栓的机会越大。
对于综合性防治高血压专家建议：改变生活方式，限盐/低脂饮食，多吃新鲜蔬菜水果，控制体重，增加活动，戒烟限酒等；在脑血栓恢复期有高血压病而未有效控制者，必须在医生指导下坚持合理有效地服用降压药物。同时应注意：脑血栓后过高的血压宜逐渐平缓降压，过低过快降压会导致脑血流低灌注，势必会促使血管内血流停滞不前而形成血栓，这也是脑血栓后痴呆的发生基础。而且要坚持定期测量血压，调节用药剂量，切不可自己随便加大剂量。
高血压治疗目标：应降至140/90mmHg；老年人收缩压降至150mmHg以下；糖尿病、肾脏病患者宜130/80mmHg以下。目前还不能确定急性脑血栓发生后开始降压治疗的最佳时间，但至少在1-3周再开始降压治疗可能比较合适。这为评估大的脑动脉的状态留出了充分的时间，因为降低动脉高度狭窄的病人的血压可能对病人不利。
有效降压的药物：复方降压片：一次1-2片，一日2次；珍菊降压片：一次2片，一日3次；
有效防治脑血栓的中西药合理并用：抗血小板聚集-拜阿司匹林：每晚75毫克；活血化瘀，芳香开窍降脂抗凝中药-天欣泰血栓心脉宁片：一次2片，一日3次。
营养，保护脑细胞：复方脑蛋白水解物片：一次4片，一日3次（癫痫患者禁用）。