裘氏对唐代医家孙思邈的学术思想和诊治经验尽发掘能事。其主要发明有：
裘氏崇孙氏《千金要方》、《千金翼方》的学术价值，倡言“《千金方》中藏万金”。他系统研讨了两书的近六千个处方有关方论后深有体会地说：“孙氏医论，重在‘诚’字；孙氏选方，克臻‘精’字”。他归纳其遣方用药的特点为：简易见长，平正取胜，奇崛跳脱，杂乱有章等。书中不仅收载了大量有效的民间单方、验方，而且还有不少似乎“庞杂繁乱”而不易被常人所理解的“大方”。对前者尚待我们深入挖掘，对后者有些医家曾有微词而不被重视。裘氏通过艰难摸索和临床体察，乃悟其方之杂，正是奥妙所在。姜桂与大黄并用，人参与硝黄相伍，体现了“制方之反激逆从”的妙用。故他在近几年治疑难杂症，亦常效法思邈，以庞杂组方或奇特配伍，也往往能起沉疴而愈危疾。
历代医家都认为温病学说开创于明清时代，裘氏则指出孙思邈是“温病治法的创导者”。例如：清代余师愚应用大剂石膏治温疫的方法实胎息于孙氏。《千金方》中治外感热病常用石膏至八两，并有多种配伍方法，以适用于不同的证情。一般医家尝谓表里双解法创自河间，而在《千金方》中早有以麻黄、葛根与石膏、寒水石同用，麻黄合大黄同用之方，开解表与清里合用或发表与通下并用的治则。后世治温病名方凉膈散、升降散和防风通圣散等，实皆由此悟出。还有治疗温病气血两燔的气营两清法、治疗温病邪火热毒炽盛的清热解毒法、治疗温病邪初入营血的凉血清热法以及辛凉解表法、甘寒生津法、芳香开窍法等，均可在《千金方》找到相应的方药，这些方药及其配伍与后世治温病者，或如出一辄，或初见端倪，或方虽不同，其法则一。孙思邈已开温病治法之先河，其功不可没。
孙思邈对养生学说的贡献不可抵估。裘氏从三个方面概括孙氏的养生观：一是养生首重养心，而养心莫善于寡欲。思邈本人之所以能g享遐龄，与其能“安神定志，无欲无求”，淡泊名利，不利低头拾卿相，誓愿普救含灵苦的品行，有很大关系。二是强调“啬神”、“爱气”、“养形”。他倡导十二个“少”(少思、少念、少欲、少事、少语、少笑、少愁、少乐、少喜、少怒、少好、少恶)，反对十二个“多”(即与十二少相反之事)，防止六个“久”(久立、久行、久坐、久卧、久视、久听)，提出十个“莫”(莫强食、莫强酒、莫强举重、莫忧思、莫大怒、莫悲愁、莫大惧、莫跳踉、莫多言、莫大笑)。三是认为“安身之本必资于食”，“不知食宜者不足以存生”，孙氏对食养提出了许多主张，诸如“食不欲杂”、“学淡食”、“食欲数而少，不欲顿而多”，做到“饱中饥，饥中饱”。孙氏还十分重视“食治”，认为“食能排邪而安脏腑，悦神爽志以资血气”。强调食物对养身和治病的重要作用。这些堪称夺食疗之先声，对今天仍有很大指导价值。