辨证施治是中医临床的根本，中医和中西结合肝病专业委员会已经对慢性肝炎的辨证分型有了统一的标准，作为临床的指导原则，临证也能够参照运用。但是慢性肝病也存在三种特殊的情况。一是各种证型重叠交杂，很少单纯的证型，因此辨证处方首要分清主次；二是有部分患者血清学检查确诊为慢性肝炎但往往缺乏自觉症状，甚至舌象、脉象也无显着的改变，对于这部分病人就存在着无证可辨的情况。然而科学的诊断不能因为没有症状就否认其疾病存在，在这种情况下，当以辨病为基础，参照慢性肝炎的病因病机病位等特点施治，一般来说，病是证的基础，证是病的表现，有病才有证，无病当无证，在治疗无症状的慢性肝病患者时，应该运用有证辨证、无证辨病的原则。例如可以根据现代医学对乙肝的认识或实验室检查进行妥善的处理。特别是解决要否治疗和如何治疗的问题。除此之外，对于慢性肝病疗效的判断也应该参照上面的原则。有充分的根据作出正确的抉择，不要因为医师的误导影响疾病的预后。三是慢性肝病的发生和演变十分复杂，虽存在内在规律，但至今尚未完全明确，因此在辨病辨证的同时要考虑“病”和“期”的动态变化，按照一般规律，慢性肝病的早期以祛邪为主，而晚期则以扶正为主，再根据病人的临床表现，综合客观检查，合理用药，以变动的治疗来达到使疾病治愈、康复的“不变”目标。
目前中医诊治慢性乙型肝炎已逐渐趋向于宏观辩证与微观辩证相结合的发展方向。中医辨证分型基本上能反映慢乙肝病程的不同阶段、病变轻重和病毒复制状态。如肝肾阴虚型慢乙肝患者白蛋白降低明显，γ－球蛋白异常增高，凝血酶元时间普遍延长，HBV复制活跃，病理损害严重，易发展为肝硬化。慢乙肝的发生发展和转归与免疫功能紊乱密切相关，因此恢复正常的免疫状态是治疗该病的关键之一，治疗选用相应的补肾药，既可收到补益肾虚之效，又可达到调整免疫功能、抑制HBV复制的目的；而调节机体免疫，抑制HBV复制，又有赖于补益肝肾作用的发挥。所以通过选择性运用补肾中药或复方，可能对慢乙肝具有“治本”的意义。
肾虚本质的现代研究主要集中在神经－内分泌－免疫上，是从细胞分子水平上认识“肾虚”，这种肾虚之象是微观的。微观的肾虚与宏观的肾虚理论相结合，对指导临床诊治将会产生积极的作用。如果微观状态的“肾虚”能及时加以纠正，阻断其进一步的发展，就不会出现中医所谓的宏观肾虚。假如系统性、大范围的肾虚证出现，则反映出慢乙肝逐步发展的过程，肝炎后肝硬化在所难免，甚至可能导致癌变。应用补肾法调节机体免疫功能和内分泌激素水平，就能控制肾虚证的出现。所以今后坚持以中医理论为指导，结合应用现代生物医学技术，从中西医结合角度对肾虚理论及补肾法在慢乙肝医疗实践中的作用机理进行更深入的探索。