杨氏对卒中的辨证分类，基本上按《金匮要略》分为中络、中经、中腑、中脏。对卒中的治疗原则是辨证论治，针药兼施，因人因病而异，灵活机动，通常达变，深得病家信仰。
针灸治疗对中脏者用平肝熄风、化痰开窍为主。常用穴位：百会、风池、水沟、太阳、曲池、合谷、阳陵泉、太溪、太冲。若火盛者，症见面红目赤，皮肤灼热，溲赤，口臭，舌质红或绛，苔黄糙或焦黄，加大陵，行间，间使，阳辅，以泻心包、肝、胆之火；痰盛者，症见体丰面白，喉间痰鸣或胸腹痞闷，苔白厚腻，脉弦滑；加足三里、内关、天突、列缺、丰隆；窍闭者，症见猝然昏仆，面赤，口噤，两手握固，息粗痰鸣，大便秘结，加中冲、涌泉，或用三棱针刺十二井穴出血；中经络半身麻木不仁，口角歪斜，言语蹇涩，或中脏腑经治后神志转清，仅留上述偏瘫症状者，取穴以舒筋活络为主，常用肩髃、曲池、手三里、外关、合谷、中渚、环跳、风市、丰隆、阳陵泉、足三里、悬钟；肘部拘挛者加尺泽、曲泽，用深刺法，有解除拘急止痛之效；肩部痛甚者，选用肩髃、肩髎深刺，或肩髃用扬刺法(正内一，旁内四)，加拔火罐，局部畏寒者用温针。
杨氏在治疗卒中的各个不同阶段，除针灸外常兼服中药，起到加速治愈提高疗效的作用。在中脏腑重症，当浊痰蒙闭期，症见神志昏迷，半身不遂，舌强不语，喉间痰鸣，或见抽搐，脉弦滑，苔白腻，治以平肝熄风，化痰开窍，药用：天麻、钩藤、竹沥半夏、僵蚕、杏仁、郁金、枳壳炭、生石决明、九节菖蒲、玉枢丹；当炽热化燥期，症见神识略清、偏瘫、失语、口臭、溲赤、大便干燥、舌尖有红刺，苔黄糙或焦黄，脉弦滑带数，治以化痰开窍，清心凉肝。药用：竹沥半夏、杏仁、郁金、全瓜蒌、川黄连、黄芩、黑山栀(或用龙胆草)、生大黄、枳壳炭、九节菖蒲；当伤阴劫津期，症见神志尚清，肢体不遂，口角歪斜，大便秘结，虚烦少寐，舌质红，或光剥无苔，脉细带数，治以润肠通腑，养阴舒络法，药用：鲜生地、鲜石斛、麦冬、杏仁、瓜蒌仁、柏子仁、远志、生黄芪、当归、地龙、桑枝、火麻仁；在中经络轻症，症见半身不遂，乏力懒言，语声低微，面色苍白，血压不高，脉象无力，苔少，治以补气，气行则血行，营卫循行得畅，肢体才能活动自如，用生黄芪煎汤代茶；若舌质紫暗，脉濡或涩者，以补阳还五汤加减；偏阳虚者，玉屏风散加减。仅遗留偏瘫，无其它不适者，用人参再造丸，每日1-2粒；若患肢疼痛者，用小活络丹，每日一丸。
曾治王×，男，48岁。2天前，夜半起床小便跌仆，神志昏朦，右肢不遂，舌强语蹇，倦怠嗜卧，时有烦躁，小溲黄赤，脉弦滑带数，舌苔黄腻，尖燥，平素常有肝阳头痛，此浊痰内盛，蒙闭清窍，逐渐化热，引动肝风，流窜经络，以致脏腑经络同病，先予平肝熄风，豁痰开窍，取穴：百会、太阳、间使、丰隆、太冲，用捻旋泻法；合谷、阳陵泉，先补左侧，后泻右侧。内服药处方；天麻、杏仁、竹沥半夏、川黄连、黄芩、石菖蒲、灵磁石、僵蚕、蝎尾、玉枢丹。针药每天1次。3天后，神志较清，问之有答，住院半月左右，出现便闭，用五仁丸方加减获效。第20天开始，能自己翻身，右手稍能屈曲。取穴：百会、风池、肩yu、曲池、外关、合谷、环跳、风市、阳陵泉、丰隆、太冲，均右侧，用捻旋泻法，针灸2天1次。中药停服。1个月后，右下肢能内服及屈曲，手指能活动，共住院71天。出院时可短途步行，右手能高举至头，惟动作稍缓慢少力而已。
杨氏早年崇尚《内经》、《金匮》的学术思想，治疗中风以外风论学说为指导，立方治法以祛风通络为主。晚年又精读《医林改错》，受王清任学术观点的熏陶，结合临床经验，体会到卒中不仅由于风邪侵袭，而正气不足是该病之本。《医林改错》对卒中半身不遂，既无寒热之表证，又无疼痛之兼证，皆属元气亏损；口眼歪斜，语言蹇涩，口角流涎，亦由气虚不摄和血络阻塞所致，乃立补阳还五汤之法，杨氏对中风后遗症的治疗，从过去的祛风通络法，转为益气活血化瘀法。又引用《素问·五脏生成篇》“足受血而能步，掌受血而能握，指受血而能摄”来说明中风后偏瘫，当是气虚血瘀，故为半身不遂。而气为血帅，气行则血行，故用大剂量黄芪的补阳还五汤以益气活血，才能通调瘀阻之经脉。从而提高了中风后遗偏瘫的恢复率，这是汇集古代医家经验的结晶，对卒中后遗症的治疗，有了全面的认识和见解。