疾病的过程，是邪正相争的过程，对疾病的发生和转归起着决定性的作用。邪胜则病进，正胜则病退，邪虽是引起疾病的重要原因，但不是唯一的原因，还取决于人体自身的抗病能力，即正气的强弱，《内经》曾曰“正气存内，邪不可干”、“邪之所凑，其气必虚”，所以，扶正可扶助正气，增强体质，提高机体的抗病能力和自然修复能力，达到祛除病邪、恢复健康的目的。正充邪自去，邪去正自安。现代药理研究也证明，扶正药物，具有改善机体的物质代谢和心血管功能，调节中枢神经及内分泌系统，增强免疫功能。所以在疾病的治疗中，要始终注意扶助正气，而不能妄用峻烈伤正之品，如耳鼻喉科肿瘤，常表现为正虚邪实，应在扶正的同时，适当加入一些抗肿瘤药，而不可大量使用抗癌药以伤正气，若正气大伤，反使抗病力减弱。又如急性咽喉部感染，临床上来势凶，病情重，用药不可避免要用泻火解毒、清热利咽之剂，但需中病即止，后佐以调治药物，这样就能无伤正气。
中医主张“治病必求于本”，《医学心悟》言：“本，为之本源也”，“善为医者，必责根本，而本有先天后天之辨”。后天之本即指脾胃，“谷入于胃，洒陈于六腑而气至，和调于五脏而血生，而人资气以为生也”，故安谷则昌，绝谷则亡，胃气一败，百药难施，由此可见保护脾胃，是扶正祛邪的重要方面，处方用药时，要时时注意，不可过于苦寒，以防败胃；选用健脾药不可过于温燥，以免损伤胃阴，多用茯苓、炒白术、淮山药等；养阴不可过于滋腻，以免助湿，影响脾胃运化，多用天花粉、制玉竹等；实热证需用苦寒药，当中病即止，以免苦寒败胃，正气受损。
用药要注意药性，宜以平和轻灵取胜，“药贵对症，虽平淡之品，亦有奇功。”且耳鼻咽喉位于头面部，病位浅近，采用轻清灵动之药，使正气疏通宣布，邪气潜消，则滞塞自通，不必用重降之药，不然，“已过病所，病不能去，而无病之地，反先遭克伐”。另外，峻烈攻下之剂不可多用，有毒的药也应慎用，如鼻出血属实热证者，可用适量大黄釜底抽薪，但宜适可而止；又如苍耳子，是通鼻窍的常用药物，但尽量少用，因为苍耳子有毒性，对于慢性鼻炎需较长时间服药，完全可以用其它整体调整，疏通鼻窍的药物代替，达到同样效果。