肝开窍于目而主于肾， 肝肾对眼的生理病理关系深巨。由于肝肾彼此间关系密切， 并因乙木属肝， 癸水属肾， 所以古有乙癸同源之称。姚氏对这个理论相当重视， 而且广泛应用于临床， 取得一定疗效。姚氏说:肝肾之相互关系， 主要表现在母子相生， 而目为肝之外候， 肝取木， 肾取水， 水能生木属肝， 母子相合， 则肝肾之气充沛， 目受其荫， 故而放明。如果母子不合， 则无论是子盗母气， 或者母令子虚， 皆能使肝肾之气不足， 不足则精气无法上荣， 目失所养， 眼病随之而起。《经》曰：“肝受血能视。”“肝气通于目， 肝和则能辨五色。”又云：“五藏六府之精皆上注于目而为之睛”而肾藏精，所以目虽为肝窍，而以肾为主，子母相生，肝肾同一治也。
且肝肾同为相火所寄，相火内阴而外阳，其性主动，而具生命活动之能力，但易妄动，妄动则变为邪火而贼人身，及于眼。目之能视惟赖神光，神光源于命门，通于胆，亦火之用事。火衰则目昏，火炎则目焚，肝肾相火对眼之生理病理具有相当重要意义。
进一步分析眼内组织构造， 则五轮中风轮属肝， 水轮属肾， 眼内神膏为胆中渗润精汗， 升发于上， 积而成者。神水为先天真一之气所化， 神光源于命门， 通于胆。真血即肝中升运滋目注络之血，真气为目内经络往来生用之气，真精为先后天之气所化之精汁，起于肾，施于胆，而后及于瞳神也。目系与脑相连而厥阴肝脉系之，同时少阴肾脉附督上额交巅络脑，又与肝脉相合，说是肝肾对眼的各个组织的关系至为密切，所以当肝肾亏损，必然影响以上组织而发生疾病。
临床上因肝肾病变而引起的眼病，为数颇多，诸如青盲、内障、能近怯远、能远怯近、视惑、视歧以及外障等，在很多情况下，都可能与此有关。发生病变的主要因素，在于肝肾精血两亏、阴不上承；阴虚生内热、虚火上炎；真阴不足，龙雷之火上游，以及水不涵木、肝阳偏亢、化风、化火等几个方面。因而治疗用药必须按照不同病因而正确掌握，古人提出的“壮水之主，以制阳光”、“益火之源，以消阴翳”，就是针对这方面的治疗原则，为眼科临床所常用。至于育阴潜阳、养肝熄风以及滋肾填精等法，亦可根据不同病情而选用。