刘氏治疗久泻，着重于祛邪，正如张子和所说“陈zuo去而肠胃洁”。他十分赞同徐灵胎在《临证指南·泄泻门》中的评语：“若滥加人参、五味，对正虽虚而尚有留邪者，则此证永无愈期”。因此主张在通法的基础上采用清利肠间湿热法，并结合现代医学检查，所见肠间有充血、水肿、溃疡等诸种情况，兼用活血化瘀法，多选用丹参、红花之类。对于腹胀痛，里急后重较甚者，则按“风能胜湿”法，选用防风、羌活、独活等药；或按“陷者举之”法，选用柴胡、葛根、桔梗之属。
刘氏认为在久病泄泻部分病人中，还需审慎辨别。脏寒的部位是脾抑在肾，还是脾肾同病，脏邪是湿热、血瘀、食积等何者偏重。其处方可仿《金匮要略》黄土汤意，以附子、灶心土、炮姜合黄芩、黄连、蒲公英、红藤等以温脏寒、清腑热，温清并用。刘氏还曾用蜣螂虫、蔗虫、地鳖虫等虫类搜剔药磨粉吞服，治愈一慢性结肠炎大便溏而不爽达20年的病家。