许多常见病，如发热、代谢性疾病或心理精神性疾患都引起呼吸频率和深度的变化。过度通气是指通气量增加超出CO2产生的需要，PaCO2降低；通气不足则相反。由于肺泡通气量与CO2密切相关，如
| PaCO2 | = | K· |  CO2 |
| A |
所示，动脉血CO2分压常可直接表示通气不足或过度。
肺内疾病如肺炎、哮喘、肺栓塞等，周围化学感受器的抑制如世居高原、镇静药、肺原性心脏病等，周围化学感受器兴奋如某些中枢兴奋剂的作用，中枢化学感受器的抑制如镇静剂、粘液性水肿、神经系统疾患等，或兴奋如药物及中枢神经系统病变，都可使呼吸控制失常。
可用吸入高二氧化碳或低氧气体测试通气反应性或者使用0.1秒口腔压（P0.1）帮助评价中枢呼吸控制功能。
呼吸控制是一复杂的生理学课题。近年来，通过对中枢及脑脊液的关系的观察及各种感受器生理功能的研究，呼吸肌的调节与控制以及睡眠呼吸障碍疾病研究等多侧面临床与科研工作的进展，对呼吸控制方面的认识有不少进展。在急诊医学的领域中也有一定涉及，值得注意。