蓼实为之使。畏紫石英。恶丹参、硝石、白垩。
辛、苦、热。有毒。入足厥阴经血分，兼足太阴、少阴经气分。疏肝燥脾，温中下气，开郁化滞。除阴湿，逐风寒。
治一切厥气上逆，厥阴头痛，呕逆吞酸，痞满咽塞，喉舌生疮，肠风泻痢，香港脚水肿，疝气阴毒，心腹诸痛，虫 疰忤，及产后余血。得硫黄、大蒜，研匀涂腹，治小儿肾缩。（初生受寒所致，仍以蛇床子烧烟熏之。）得茯苓，治痰饮。得盐水，暖膀胱，治脾泄。（他药虽热不能分解清浊。）得干姜，治干呕及吞酸。（因火而酸勿用。）
配橘皮、附子，治肾气上哕。配川连，治下痢水泄。醋调贴足心，治喉舌生疮。（性虽热而能引热下行。）
陈久者良。闭口者有毒。拣净，并去梗，泡去苦汁，晒干炒用。止呕，以黄连水炒。治疝，盐水炒。治血，醋炒。
散寒，酒炒。生嚼数粒，擦痘疮口噤。多用伤神损元气，动火昏目，发疮咽痛。病非寒滞有湿者勿用。即有寒湿者，亦宜酌量少用。下气最速，阳虚者禁用。
怪症∶寒热不止，数日，四肢坚如石，击之似钟磬声，而形体日渐瘦削，此肝气结也。
合木香等分，疏其肝气自愈。
吴茱萸得东方震气，直入厥阴，招其垂绝不升之阳，以达上焦。仲景于少阴症手足厥冷，烦躁欲死者，用吴茱萸汤重固元阳于厥阴之中，良有以也。王又原曰∶少阴厥阴，俱有烦躁。
少阴之躁在水，由龙火不归，姜、附得以回阳。厥阴之躁在木，乃雷火上逆，用姜、附则重其震烈矣。吴萸、姜、附，性俱大热，而主治不同。错用之，反伤元气，元阳即旋消散，更何药之可救。