男性生殖系统外部结构包括：阴茎、阴囊、睾丸，内部结构包括：输精管、尿道、前列腺和贮精囊。
睾丸产生携带男子基因的精子并贮存在贮精囊内。在性交时，精子随着精液通过输精管和勃起的阴茎射出。
男性生殖系统
结构
阴茎由根部、体部和头部（龟头）组成。根部紧贴腹壁，中段为阴茎体，末端为阴茎头呈锥状。尿道是排出尿液和精液的通道，开口在阴茎头的前端。阴茎头的底部称为冠状沟。未行包皮环切术的男性，其包皮从阴茎冠状沟延伸覆盖整个阴茎头。
阴茎体由三个长柱状、有空隙（窦）能勃起的海绵状组织构成。两个较大的海绵体并排平行排列于阴茎背侧。另一个为尿道海绵体，包绕着尿道。海绵体内的空隙里充满血液时，阴茎就勃起，变得粗硬。
阴囊是一个薄薄的皮肤囊，它包围着睾丸并保护它。阴囊具有调节睾丸温度的作用。因为睾丸要保持比体温稍低的温度，才能使精子正常发育。阴囊壁上的提睾肌松弛时，睾丸离身体较远，而使温度降低。提睾肌收缩，睾丸则靠近身体，使温度升高，同时也得到保护。
睾丸位于阴囊内，呈卵圆形，如大橄榄大小。通常左侧睾丸比右侧略低。睾丸有两个功能：产生精子和合成睾丸素（最主要的男性激素）。附睾位于睾丸上方，是由约6米长的细管盘绕而成。它从睾丸收集精子，并为精子成熟提供了一个合适的场所和环境。
输精管是从附睾输送精子的索状管道。一侧的输精管从同侧睾丸出发，上行到前列腺后方进入尿道形成射精管。其他结构，如血管、神经也与输精管一起形成索状结构，称为精索。
男性尿道有双重功能。一是从膀胱排出尿液（属泌尿系统），二是射出精液（属生殖系统）。
前列腺在盆腔内，位于膀胱下方，包围后尿道。通常前列腺如核桃大小，随年龄增大而长大（参见第229节）。前列腺和位于它上面的贮精囊产生滋养精子的液体。精液总量的大部分是这种液体。精液中还有来自输精管和阴茎头分泌腺的其他液体。这种含有精子的分泌物，在射精时被排出体外。
功能
性活动时，阴茎变硬、勃起，性交时能插入阴道。勃起是由神经、血管、激素、心理等一系列复杂因素相互作用引起的。由感觉器官产生的兴奋，刺激大脑发出神经信号，通过脊髓传到阴茎。致使阴茎动脉扩大供血，充盈海绵体间隙，使海绵体膨胀。同时，阴茎静脉周围的肌肉收缩，使血液回流减慢。阴茎内血压增高，使它变得更长更粗大。
当摩擦阴茎头，或用其他的刺激不断向脊髓和大脑发出信号，可使性兴奋达到高潮，发生射精。射精的过程是兴奋的神经刺激使附睾、输精管、贮精囊和前列腺周围的肌肉收缩，迫使精液进入尿道，同时，尿道周围的肌肉收缩，进一步使精液从尿道射出体外。射精时膀胱颈肌肉收缩，以免精液向膀胱返流。一旦射精发生，或刺激停止，阴茎动脉就收缩，静脉松弛。这样，流入阴茎的血流量减少，流出的血流量增加，阴茎又变得疲软复原。