《内经》、《伤寒论》在反复阐明人体生理、病理变化与年、月、昼夜阴阳气交规律密切相关的基础上，强调不论采取针灸或方药治病，均应顺乎时序更替的变化。蔡师遵循前圣教导，在长期临证治疗中探索、创立了一整套妇科审时论治的学说和方法，颇具特色。
1．倡导周期调治法。月经及生育的月节律早在战国时期已有认识。至明，《本草纲目．人部》对此有了更明确的论述：“女子，阴类也，以血为主。其血上应太阴，下应海潮，月有盈亏，潮有朝夕，月事一月一行，与之相符，故谓之月水，月信、月经”。正常月经是女子发育成熟的重要标志，由此而出现经、带、胎、产、乳等一系列生理和病理变化。张景岳《妇人规．经脉诸脏病因》中曰：“女子以血为主，血旺则经调而子嗣，身体之盛衰，无不肇端于此。故治妇人病，当以调经为先”。蔡师甚崇此说，认为妇科确当以调经为首重。而调经之道，在于明审月经周期节律，根据不同时期阴阳气交生理特点，进行适时适当治疗，方能获事半功倍之效。故早在70年代初，即在长期临证实践的基础上，提出了月经周期的四期生理特点和调治思路。蔡师指出；在以肾气为主导，受天癸调节，又因肝藏血、调血，脾统血、化血，心主血，肺布血的协同作用下，冲任气血相产资胞宫由虚而盛而满而溢又虚的月经周期中，随着阴阳消长，气血盈亏而出现月经期、经后期、经间期、经前期的变化。月经期(经水来潮至净)：胞宫气血由满溢泻渐至空虚，肾气、天癸作用相对消减。凡经期、经量、经色及经味异常均可在此期调治。常用疏调、通下、固摄诸法。经后期(经净至排卵前)：胞宫气血由虚至盈，肾气渐复渐盛，从阴阳论是阴长阳消之时。此期是调经、种子、消症的基础阶段，当补则补，当泻则泻，随其从而治之。经间期(排卵期，即下次月经期前14天左右)；此期肾气充盛，是阴阳转化，阴极生阳，阳气发动，阴精施泄的种子时期，若交接合时有受孕可能。治疗以促期阴阳转化为宗旨。经前期(排卵后到经潮前)；此期肾气实而均衡，阳盛阴长，气血充盈，治疗以维持肾气均衡为原则，又是调治月经前后诸疾及经期诸疾的关键时期。在具体治疗中，蔡师又将四期生理和妇科诸疾的病理特点有机结合，制定出不同的周期调治法，并创立一系列自拟方剂。如治疗不孕症之“育肾助孕周期调治法”：即月经期以理气调经之“四物调冲汤”加减治疗；经后其以育肾通络之“孕Ⅰ方”加减治疗，经间期及经前期以育肾培元之“孕Ⅱ方”加减治疗。治疗子宫内膜异位症之“化瘀散结周期调治法”：即经前一周及经期，痛经型用化瘀止痛之“内异Ⅰ方”加减治疗、崩漏型用化瘀调摄之“内异Ⅱ方”加减治疗，经后期至经前期均用化瘀散结之“内异Ⅲ方”加减治疗。治疗子宫肌瘤之“化瘀消坚方”加减治疗；月经期用“化瘀调摄止崩方”或“化瘀调摄止漏方”加减治疗。其它如治疗闭经之周期 调治法：治疗功能性子宫出血之周期调治法；治疗多囊卵巢综合症之周期调治法等，均在临床取得较好疗效。
2．开拓年度调治意识。蔡师在长期大量诊治不孕症过程中发现，每至春季，治愈病人即会显著增多，根据“天人合一”的观点，此现象与古人“春主生发”理论颇相吻合。于是对两组资料进行了前瞻性统计分析：一组是蔡师1983年4月～1988年3月间治愈的167例不孕症病人；一组是1987年1～12月在上海第一人民医院分娩的3608例产妇；均以推算排卵日的方法进行分季归类。结果表明，两组资料的受孕最高季节均在春季，但这种春季受孕率高的现象在不孕症组显得十分突出，经气象敏感度(M值法)测定，春季治愈有增加倾向(M>2)，其他三季均是减少倾血(M<1)。蔡师认为：尽管正常组的调查人数远远多于不孕症组，但正常人群由于对性知识的了解和掌握以及计划生育工作的广泛开展，人们根据各自不同的工作、学习、家庭、自身体质等情况以及对最佳分娩期的不同理解，有效控制和选择着适当的受孕期。因而受孕季节的人为性影响很大。而不孕症病人，在经过至少是两年的不孕忧虑后，希望早日受孕的心情非常迫切，病人一般均在医生指导下，十分认真注意着排卵期的交合，故而人为性影响甚少而更符合自然规律。此项调查分析提示，人类生育除有一个月节律外，确实还存在着年节律的变化。
蔡师指出：“春主生发”之论是基于前贤对阴阳观的认识上。春温夏热秋凉冬寒，在这阴阳消长中，蕴育着万物的生生化化。其中阳气始终起着主导作用。一年之阳始于春，春天阳生则万物亦生；夏天阳盛则万物趋长；秋天阳减则万物为收；冬天阳衰则万物乃藏。故曰：“天之大宝，只此一丸红日”，以之喻之，则“人之大宝，只此一息真阳”，“所以成吾身者，即真阳之气也”(《类经附翼．求正录．大宝论》)。所以有二七、二八之变；四七、四八之壮；六七、六八之憔；七七、八八之谢，亦皆主归于肾阳之气的盛、实、衰、竭。而人生于天地之间，宇宙之阳必能助化、影响人体之阳。张介宾曾明确提出：“凡阳气不充，则生意不广”的病理概念。时间生物学和神经内分泌学的研究和发展使人们拥有大量事实证明：季节相代，昼夜交替所形成的光线变化，对哺乳类生殖功能的影响主要是通过改变松果体活动来实现的。光线能抑制其分泌，黑暗则反之。因而昼长夜短的光照周期，能使性腺功能处于相对最佳，从而有促进受孕作用。这种新观点，不仅从一个侧面动摇了狭义的“自身稳定”在现代生理学乃至整个医学中的统治地位，也为古老的中医理论提供了科学依据。
蔡师言，虽然夏天乃昼最长夜最短季节，秋季和春季之昼夜长短相似，但是冬去春来，是一个由昼短变为昼长的过程，所谓“阳气渐长，阴气渐消”，对生殖功能来说，是从被松果体长时间抑制逐渐转为短时间抑制，性腺活动的“自由度”在增大。从阴阳论，则阴气适从盛极而衰，阳气则生而上升，可谓是阴实阳充，故而能使人类生育功能处于相对最佳。对不孕症病人来说，机体的自身条件基础差，当有效的治疗使她们体内的不孕因素逐渐减少时，良好的生殖环境，可使其不孕因素变得更小更弱，于是“两精相博，形神乃成”。春季治愈率高现象的实质即基于此。1989年，蔡师带着这一学说，参加全国第四届中医妇科学术交流会，推荐大会发言后，引起较强反响，得到充分肯定。
蔡师在创言人类生育年节律学说的前提下，积极利用这一规律探索、开拓治疗不孕症的思路和方法。鉴于目前许多不孕症患者，在中药治疗中均有长期服药之累，少则几月，多则愈年，在治疗的同时，也因持续地看病，煎药、服药、测基础体温，择时交合等治疗措施，带来了颇多颇重的心理负担。且长期服药，也易产生耐受性。蔡师提出：如果我们运用时间治疗学适时治疗能提高疗效的定理，利用年节律规律，着重于冬、春两季进行治疗，对于中药治疗不孕症，或许能达到缩短治程，提高疗效的作用。近年来，蔡师正在对两组病人进行临床观察，一组是四季均长期用育肾助孕周期调治洁治疗的不孕症患者，一组是仅在冬、春两季用育肾助孕周期调治法治疗的不孕症患者，目前此项观察仍在进行中，能否达到预期目的，有待观察结果。