尽管病证繁多，方海浩瀚。根据治病求本，辨证施治的原则，把握病机，一方多用每每见效，在临诊治疗中，秦师酷爱应用补中益气汤。本方根据“损者益之”，“劳者温之”，“甘温除热”的理论而制订，方中用黄芪补中益气，升阳固表；用人参、甘草、白术、甘温益气，补脾益胃；升麻、柴胡协同参、芪以升清举阳，使下陷之气得以升提，当归补血和营；陈皮调理气机。诸药合用，使脾胃强健，中气充足，气陷得升。
用本方的依据在于因脾主运化，升清，统摄血液，又为气血生化之源，向称“后天之本”，脾与胃同居中州，相互依存；同时上与心肺，下与肝肾，无论在生理上或病理上均有密切联系，脾病可以影响他脏，他脏之病亦能及脾，所以脾虚功能失常，往往可能产生全身病变，因此通过健脾益气，以恢复中气，不仅能协调五脏的关系，而且使水谷精微输布，全身气运流畅，生机即随之旺盛，从而可以扭转病势，使多种疾病逐渐痊愈，基于这一理论基础，临诊施药本方被广泛应用于虚劳之症。