闭经的成因与肾气、天癸、冲任的盛衰及胞宫的营养发育情况直接相关，并与脏腑功能的失调有密切联系，所以临床上也多见肝肾不足、气血虚亏及气滞血瘀的类型。
生殖系统的生长发育，需赖先天肾的作用，又靠后天脾胃的补养，如果先天不足、早产或后天失调、营养不良及疾病侵袭，则肾精减少，影响机体发育，导致天癸生成不足，从而延迟月经周期。临证时详细询问，了解有关先天不足，后天重病、大病的损伤，从而判断“天癸”的盈缺、肾气的虚实，掌握闭经的真正原因。另外还须了解患者工作学习生活情况，闭经患者中以青春期少女较多，尤其以高中阶段的学生为常见，究其原因，大都学习普遍紧张，导致心理压力过大，或工作繁忙，加上家庭社会因素等造成情绪不舒，除主诉闭经外，有胸闷、胁胀、多思忧愁、注意力不集中，寐少等。《万氏女科》说：“忧愁思虑，恼怒怨恨，气郁血滞而不行。”因此，在辨证上则以气滞肝郁为主。
在治疗方面，强调通经活血理论，泻实补虚贵时机。虚者，气血肝肾不足；实者，气滞血瘀与痰湿。故养血活血是主法，行气舒肝常左右行使，常用丹参、香附、桃仁、红花、当归、熟地、白芍、川芎等，其变化在于虚者重以补，实者主以攻。
气血不足闭经，先以“圣愈汤”补益气血，同时注重益气健脾，待气血渐复后，再逐步加用活血通经之品；气滞血瘀者，以逍遥合桃红四物加减；肝肾不足者，补益肝肾，同时注意阳气生化推动。
另外，运用温阳行气之品治疗闭经，以调整人体脏腑机能，阴阳平衡。循“脾得阳助健运旺，经血有源冲任盈；肾得阳助精气足，天癸至盛月经调；血得阳助运行畅，血海满盈经自通；寒湿痰浊用温阳，益火之源消阴翳。”处方用药常用仙灵脾、仙茅、巴戟天、葫芦巴及肉桂、鹿角等。
妇女以阴血为主，以肾为本，初诊病不宜过用峻猛破气破血、砍伐正气之品，以免虚不耐攻或经行过度，或即使月经被迫来潮，下次闭经又难免。要获得治疗闭经良效，必须正确辨证，治疗时掌握攻补时机，使阴阳平衡，气血调畅。