王氏认为，湿温虽属外感时令之邪，但必先内蕴湿热。其发于夏者，多挟暑热；发于秋者，多由新凉引动。其认为，湿温的病机特点，一为湿热交蒸，一为邪滞互阻。临床辨证应分析湿热之偏胜，邪滞之深浅；其论治，以分化湿热、消导肠滞为要。其认为，湿不化则温不解，滞不导则邪不撤，此外，更应分辨表里传变，邪正盛衰，宿恙兼病等。王氏在辨滞、导滞方面，尤有深入的研究。在湿温病治疗过程中，又十分重视存阴保液。
(1)辨滞：主要是观察大便，察舌验齿。观察大便色泽形态，可知湿热邪滞蕴阻情况，推论病势趋向和转归。湿温轻症或暑湿内阻，大便色泽形态一般无变化。，或仅略有燥结，或色泽始终较深者，治以芳香疏化，即能热解病退；湿温较重者，大便多见溏垢粘腻，色泽深褐。邪热越甚则色泽尤深，质更粘腻而胶着肠壁，中间稀薄者排出，状如便泄，实乃湿滞胶结，治拟泻下导滞。前人云：“热病便泄稀薄，肠滞不清，仍宜应下法”。若便泄纯属稀水，日夜频繁、色褐或黄者，系协热不利，为逆候；若下利不止，津液内夺，势必导致神昏内隔，须先止其利，以回津液，后导其滞。王氏认为，察舌验齿对辨滞的意义尤大。舌苔黄腻厚浊，口苦气臭、矢气频传、脘腹拒按，均为里滞内结之征。若舌干唇焦、必有里滞；唇焦齿板互见，则热极滞甚，将次传营而昏厥，如药后肠滞逐渐下达，则唇红唇焦亦逐步消退，而且一般都从上唇开始消失，热势亦随之下降。
(2)导滞：王氏治湿温邪滞，主张趁早攻导肠滞，使湿热之邪无所凭藉，既可削弱病势，又可控制出血趋势。导滞之法，则根据各阶段的不同表现，采用不同方法。早期表邪未达，里滞已结，则用表里双解，一般先用枳实栀子豉汤加槟榔、山楂、六曲；滞甚加大黄、芒硝、云明粉。若邪已传里，湿已化热，证属阳明腑实，则以急下存阴之法。若症已逾旬，粪便粘着肠壁、非攻导之剂所能下，则用坚肠清热，化滞缓导之法，常用之药有黄连、黄芩、枳实炭、山楂炭、银花、芍药等。旨在使粪便逐渐干燥，脱离肠壁，兹后若见矢气频转，为肠滞逐步下行之兆；若药后仍无大便，可用猪胆汁或蜜煎导灌肠；若所下不多，切勿躁急，可稍增剂量，若大便稀泄，色褐如水，次数频多，则必须先止其泄。一般先用六一散、赤苓、扁豆衣、白芍炭、通草等以利小便实大便，甚则参用坚肠清热之剂加炙粟壳以止泄。王氏治疗协热下利，每用熟石膏、生甘草二味，其效甚著。盖熟石膏能清热敛肠，生甘草能解毒固液，二味协同，具有清热止泄之功。乃固液止泄，以守为攻之法，旨在保津导滞。在病势鸱张复杂的情况下，能正确掌握，辨证应用，可转危为安。王氏总结导滞经验为：“旬日前可用攻导，旬日后要坚肠清导。攻导宜早，迟则多变；消导宜缓，峻则不去”。
(3)存阴保液，回阳固脱
王氏对湿温病各个阶段，都非常重视阴液之保存。其早期应用达邪导滞法，旨在减少阴液之绝失。热盛极期，唇燥舌绛，劫津化燥，每用大剂三鲜、五汁、增液汤等救治。另以石斛、生地、沙参、芦根、茅根等煎汤代茶，或用西瓜汁、银花露等代茶，日夜频频给服，不得中断。若津液得复，每能出险入夷。若患者素体虚弱，湿温早期发汗过多，后期每易出现亡阳之变，王氏常以独参汤加红枣煎服。甚者加附子、龙骨、牡蛎回阳固脱。尝日：“温病之亡阳，与伤寒不同，多为阴液先绝，阴不敛阳而致阳气续脱，待阳气一回，仍须气阴兼顾耳”。可见，王氏治疗湿温病十分重视保存阴液，固摄阳气。
此外，对湿温病肠出血，王氏亦有独到之经验。凡热盛正气未衰者，每用犀角地黄汤加熟大黄；体虚脉细软者，用黄连阿胶汤，另用蒲黄、地榆末吞服，每获良效。