滑胎一症，巢元方谓“血气不足，故不能养胎，所以致胎数堕”。朱氏遵循前贤，认为本症以肾气虚弱，冲任受损者居多。为防微杜渐，应在怀孕兼有腰酸之象时即行服药安胎，以免一旦流血，旋即难免胎坠不及。治疗本症，要掌握3个原则:一是补气益血，凡有小腹重坠感觉，为中气不足，带脉失固，可用黄芪、太子参补气。益血乃是养胎助育之需，习用熟地、阿胶。二是益肾固胎，肾气不足则元不固，胎动不安或胎漏下血，应补益肾气以强冲任，使胞胎稳固，杜仲、续断为其常用之品。三是健运脾胃，因脾胃为水谷之海，生化之源，消化吸收，输布津液与母胎的营养和健康关系密切。朱氏安胎常用方药为:太子参、土炒白术、白芍、阿胶、杜仲、续断、桑寄生、藕节、苎麻根。朱氏又强调指出:素有滑胎者，不宜生育过密，否则屡孕屡胎，以致气血虚亏，冲任损伤，嗣后终难受孕。每逢滑胎者，叮嘱小产后必须避孕半年，且服杜仲、续断、菟丝子、覆盆子、紫河车、黄芪、生地等品调补奇经，使受损之胞宫得以充分复原后再行受孕，则胎元结实，不致轻易滑坠。朱氏认为，滑胎者见红来诊，胎元已损，难以挽回，腰酸一症可为小产预兆，此时即以安胎，常能使胞胎得固。
朱氏学术思想渊源于《内经》、《金匮要略》，博采《妇人良方》、《济阴纲目》、《傅青主女科》、《竹林女科》等医著，尤其是推崇宋代陈自明《妇人良方》和明代武子望《济阴纲目》中治疗妇人病的处方用药。朱氏治病主张务求其本，重视气血、脏腑、经络理论，尤其调肝和奇经学说的运用。认为妇人以血为主，而肝为藏血之脏，与冲任血海密切相关。奇经盘踞于小腹，小腹又为经、带、胎、产之疾的病变所在，故妇人内伤杂病的治疗非深究奇经难以获效。审证注重诊乳，以察肝气的条达或怫郁；又注重按腹，以辨胎孕或症结。朱氏常谓:“妇人病多隐微，必须详问细查，方能确切诊断，则用药无不中鹄。”临床善治崩漏，痛经，不孕，子痫等证，对药物的使用和配伍具有特殊的见解和心得。朱氏强调指出，治疗妇人病应掌握服药时间，才能提高疗效。如他治疗痛经一症，根据不同病因类型，其治疗时间也有所不同。痛经属气郁型者，在经前感到乳胀胁满时，就应服用疏肝理气药，使肝气条达，气血运行复常；属血瘀型者，应在行经初期，给以活血调经药，使“瘀滞”即时给以得散；属虚性者，必须平时服药，行经期不须服药，同样能治愈痛经。此外，朱氏治病既不拘一病一方，亦不局限内服汤药，兼用内外合治，或单用简便外治方法而获奇效。如曾治一例鼻渊病家衄血不止，症势猛急，急取附子研碎糊并贴于足心涌泉穴，再以冷湿毛巾外敷风池穴，衄血须臾即止。又如对患盆腔炎腹部触及包块者，除内服汤药外，又用川椒、大茴香、乳香、没药等共研细末，以面粉、高粱酒少许调和敷于患处，再以热水袋温熨，腹部包块每能消散。