1．探病机，多责气阴两虚
复发性口腔溃疡目前多认为外感邪毒，内伤脏腑化火上攻，为其主要致病因素，以实证为主，很少言及气虚致病。然而本病为慢性疾患，由火引起，且多由虚火所致，为机体阴阳失调的结果。正如《寿世保元·口舌》篇所说“口疮连年不愈者，此虚火也”。而引起虚火的本质为气虚而阴不足，阴不潜阳，虚浮于上，火热乘心，口疮乃作。
2．论治法，要在益气养阴
根据对复发性口腔溃疡病因病机的认识，立益气养阴调整阴阳为治疗大法，佐以清热降火，重用黄芪，生地。基本方：生黄芪30g 生地30g 太子参12g 北沙参9g 玄参12g 石斛15g 知母15g 赤芍15g 仙灵脾15g 细辛9g 苍耳子30g 辛夷15g 生甘草9g。对口腔溃疡发作甚伴灼痛剧者，可加用蛇舌草或蒲黄，功能清热解毒，具有抗炎作用。
治疗本病用药独到之处：1)补气用黄芪生而不炙用，因生用黄芪药纯力专，益气固表，托毒生肌，直中病机，可促使口腔溃疡早日愈合，现代药理发现生黄芪有调节免疫功能，改善微循环作用，可针对病因，同时加快溃疡的修复。2)生黄芪伍用大剂量生地，益气养阴，两者协同可提高免疫功能，尤其适合免疫功能减低患者。3)苍耳子、辛夷虽为祛风药，但药理研究发现亦具有抑制过敏反应，调节免疫功能的作用。4)仙灵脾、细辛可调整阴阳，引火归元。
3．防复发，生用重用黄芪
本病最大特点是容易复发，故治疗其复发是不容忽视的环节。无论是因虚致病的还是由实致病，黄芪的应用均可起到治疗和控制复发的作用，且宜生用、重用。因为人体疾病的产生，无不与元气有关，而黄芪正是扶助元气最为适宜之品。此所谓“正气存内，邪不可干”。