慢性肾炎(包括肾病综合病，IgG肾病等等)是门诊中就诊与复诊次数较多的病种，患者常以乏力、面浮肢肿及蛋白尿就诊，病情缠绵，有些因调养不当或失治而进展到慢性肾功能不良，甚至尿毒症阶段。
此类病人何老分析其病机，属脾肾气虚，湿浊潴留，病久者气滞水停以至血瘀出现。
《景岳全书·肿胀》有“凡水肿等症，乃肺脾肾相干之病，盖水为至阴，故其本在肾，水化于气，故其标在肺；水惟畏土，故其制在脾”之说。肾气亏损或肾阳虚衰则气化不利，开阖失常，既不能固摄精气，又不能排泄湿浊。真如《内经·水热穴论》云：“肾者，胃之关也，关门不利，故聚水而以其类也。”临床上一面是尿蛋白持续大量流失，渐至血清蛋白偏低；一面是血胆固醇、尿素氮与肌酐反而增高……即所谓“清阳不升，浊阴不降”也。患者病久可见面色晦滞，或见溺血，或水肿，胶着不退。气行则血行，气滞则血滞，血滞则水停，气滞水停必致血脉瘀阻。
基于上述分析，何老治疗慢性肾炎蛋白尿，主张采取调益脾肾，利水泄浊，配合活血化瘀法，切中病机。
具体治疗上，脾阳不振者，常用益气健脾之党参、黄芪、茯苓、山药配合利水泄浊之泽泻、米仁等等。对于伴有上感，扁桃体炎等出现舌质略红、苔薄黄、脉象滑数者则于健脾利水药中，加入银花、连翘、板兰根、生地等以清热解毒。易外感者可加用玉屏风散，取其固卫表之意也。
对于肾虚，常以见症不同分别论治：肾气不足或气阴两虚的用六味地黄丸、麦味地黄丸类加减；肾阳虚或阴阳俱虚而有畏寒肢冷，腰酸浮肿较重者，常用金匮肾气丸、济生肾气丸或加菟丝子、仙灵脾、补骨脂、葫芦巴。对于以前曾用激素，或治疗过程中激素减量、停用而出现面色苍白、神萎、纳谷不馨、脉微弱等症状时也以金匮肾气丸加菟丝子、仙灵脾、补骨脂、葫芦巴、巴戟肉温补肾阳，取温而不燥，补而不滞之意。
临床常见有些患者服用激素较久，见面色较红，舌质偏红，脉弦，易兴奋，烦躁或血压偏高者，常以六味地黄丸加龟版、知母、黄柏以滋阴清火，有时酌加钩藤、黄芩、夏枯草、白蒺藜以清热平肝，滋水涵木。
临床遇到常服肾上腺皮质激素的患者，有易感染而发生咽炎，服用温补药后，咽痛加剧，病情不易稳定，实是真阴亏虚，水火不济，火炎灼金，金水无以相生，改用滋阴清利法用生地、熟地、玄参、知母、黄柏、龟版、大蓟、小蓟、石苇、板蓝根、米仁，药后症状消失，蛋白逐渐减少直至转阴，便可逐步撤去激素。
对于尿蛋白长期不降，其病机与脾肾虚损有关，脾气虚者，投以补中益气汤、参苓白术散等方药；脾肾气虚者，结合肾虚法随证施治。小便不利的应用金钱草、（艹扁）蓄草、茅根、玉米须、车前子、怀牛膝等以利水泄浊。
对于个别使用雷公藤片降尿蛋白的患者，常见有胁痛，纳呆，乏力，转氨酶升高等肝功能损害症状，何老则在原方基础上加用清热解毒、疏肝利湿的板蓝根、茵陈、平地木等，以调和肝脾。
有的患者病程较久，尿检蛋白和红细胞并见，或交替出现，又见面色萎黄，神疲乏力，舌质瘀紫，当作瘀血论治，何老常在益气补肾药中增加当归、丹参、益母草、马鞭草等活血化瘀之品，以补气药推动活血行瘀能力，使瘀血消失，循行归经。
对于慢性肾炎伴有肾功能不良的患者，除采用调益脾肾，利水泄浊，配合活血化瘀药外，常加制半夏、陈皮、竹茹等和胃止逆，生大黄通腑泄浊，从而缓解了病情。