潜伏期2～3天，预防接种后可延至9～12天。临床上大多表现为腺型、肺型及二者继发的败血症型。近年来轻型及隐性感染也相当常见。轻型仅表现为不规则低热，全身症状轻微，局部淋巴结轻度肿大、压痛，无出血现象；本型多见于流行初、末期或预防接种者。除轻型外的其他各型，起病急骤，均有较重的毒血症症状及出血现象。
（一）腺鼠疫 最为常见，多发生于流行初期，淋巴结在病程第1天即有增大，伴红、肿、痛，于第2～4天达高峰。腹股沟淋巴结最常累及，依次为腋下、颈部和颌下，一般为一侧偶或双侧、多处同时出现。肿大的淋巴结可化脓溃破或逐渐消散，溃破后伤口愈合较慢。
未及时治疗的多数患者，在淋巴结肿大后病情加剧，而于3～5天内因严重毒血症、休克、继发败血症或肺炎而死亡。如能渡过1周，则恢复机会增多。
（二）肺鼠疫 多见于流行期的高峰，患者毒血症显著，在24～36小时内出现咳嗽、呼吸短促、紫绀等，继而发生较著的胸痛，最初痰量少，后转稀而多，色鲜红而含泡沫，有大量病菌。呼吸困难和发绀加剧，而肺部仅听到散在罗音或胸膜摩擦音，故症状与体征很不相称。患者可因休克、心力衰竭等而于2～3日内死亡，临终前患者全身皮肤呈高度发绀，故有“黑死病”之称。
（三）败血型鼠疫 可原发或继发，原发者的病情险恶，乃人体抵抗力弱而病原菌毒力强、菌量多等所致。全身毒血症症状、中枢神经系症状和出血现象均极严重，体温过高或不升。患者谵妄或昏迷，并出现休克或心力衰竭，处理不及时每于数小时至2～3天内死亡。
（四）其他少见类型 除轻型如上述外，尚有皮肤鼠疫、眼鼠疫、扁桃体鼠疫、肠鼠疫、脑膜型鼠疫等，不一一详述。
各型鼠疫的病程一般为1周左右。