重症脑血栓发病早期，脑水肿并发脑疝直接威胁着病人生命。当渡过这一危险期后，接踵而至的主要危险之一就是并发肺部感染。
重症脑血栓容易并发肺部感染的原因是：①原有支气管炎。②病房内交叉感染。③昏迷时口腔分泌物或呕吐物被误吸入肺部。④长期卧床造成肺部淤血。⑤原有轻微感染致排痰不畅。⑥重症情况下患者的抵抗力降低。针对这些原因，应采取的主要预防措施为：①病房加强通风、消毒，控制探视及陪住人数，以避免空气污染。②各种操作，尤其是呼吸道插管、吸氧等，均应严格执行无菌操作。③加强基础护理，如口腔清洁护理、合适的体位、定时翻身拍背、吸痰等。
重症脑血栓病人的年龄多数较大，加之昏迷，因此发生肺部感染后的临床表现和一般的肺部感染常不相同：①由于机体反应能力较差，部分患者可能没有发热，而仅表现为呼吸次数增多或紫绀等缺氧现象。②患者不会咳嗽。③因呼吸比较浅表，肺部湿性哕音常不明显。④患者往往有广泛却不太严重的坠积性肺炎，故胸部摄片也易被漏诊。根据这些特点，不能等到患者有明确的肺部感染证据时才开始治疗。如患者的体温略升高，呼吸和心率较前加快，痰量稍增或微黄等，就应及早开始抗生素治疗。
革兰阴性菌感染常选用氨基糖甙类抗生素，如庆大霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素或多粘菌素等。革兰阳性菌多选用青霉素类、红霉素及林可霉素。由于该类肺炎常在机体抵抗力降低情况下发生，故致病菌以条件致病菌多见。例如：绿脓杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎杆菌或真菌等，且多在医院内发生。常为混合性感染，故应联合使用抗生素。理论上以细菌药物敏感试验确定的敏感抗生素最为合理，但限于标本采集条件及细菌培养需要时间，临床上很难以此作为参考。目前多数医院仍然是根据经验选用抗菌药物，并根据临床疗效及时予以适当调整。